Paket: ncbi-entrez-direct (19.2.20230331+dfsg-3 und andere)

[ Quellcode: ncbi-entrez-direct  ]

NCBI Entrez utilities on the command line

Entrez Direct (EDirect) is an advanced method for accessing NCBI's set of interconnected databases (publication, sequence, structure, gene, variation, expression, etc.) from a terminal window or script. Functions take search terms from command-line arguments. Individual operations are combined to build multi-step queries. Record retrieval and formatting normally complete the process.

EDirect also provides an argument-driven function that simplifies the extraction of data from document summaries or other results that are returned in structured XML format. This can eliminate the need for writing custom software to answer ad hoc questions. Queries can move seamlessly between EDirect commands and UNIX utilities or scripts to perform actions that cannot be accomplished entirely within Entrez.

Andere Pakete mit Bezug zu ncbi-entrez-direct

• dep: curl

  Befehlszeilenwerkzeug zur Dateiübertragung mit URL-Syntax

  oder wget

  Lädt Dateien aus dem Web

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• rec: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: curl

  Befehlszeilenwerkzeug zur Dateiübertragung mit URL-Syntax

• sug: libxml-simple-perl

  Perl-Modul für das Lesen und Schreiben von XML

• sug: libxml2-utils

  GNOME-XML-Bibliothek - Dienstprogramme

• sug: perl

  Larry Wall's Practical Extraction und Report Language

• sug: unzip

  Entpacker für .zip-Dateien

ncbi-entrez-direct herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
arm64	19.2.20230331+dfsg-3+b3	5.410,5 kB	26.287,0 kB	[Liste der Dateien]