Paket: cd-hit (4.8.1-4 und andere)

[ Quellcode: cd-hit  ]

Programme zur schnellen Gruppierung von Sequenzen

cd-hit enthält eine Anzahl an Programmen, um Sequenzen zu gruppieren. cd-hit gruppiert Proteine zu Clustern, die eine benutzerdefinierte Ähnlichkeitsschwelle einhalten. cd-hit-est ähnelt cd-hit, gruppiert allerdings Nukleotidsequenzen (ohne Introns). cd-hit-est2 ähnelt cd-hit-est, vergleicht jedoch zwei Nukleotid-Datensätze. Eine Anzahl an weiteren zugehörigen Programmen sind ebenfalls in diesem Paket enthalten. Weitere Informationen finden Sie im Benutzerhandbuch von cd-hit, das auch Teil dieses Pakets ist.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: role::program, use::comparing, Arbeitet mit: Biologische Sequenz

Andere Pakete mit Bezug zu cd-hit

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction und Report Language

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
arm64	4.8.1-4+b1	496,6 kB	1.428,0 kB	[Liste der Dateien]