Paket: bcftools (1.20-2 und andere)

[ Quellcode: bcftools  ]

Aufruf und Manipulation genomischer Varianten von VCF/BCF-Dateien

BCFtools ist eine Reihe von Dienstprogrammen, die Variantenaufrufe im Variant Call Format (VCF) und dessen binärem Gegenstück BCF bearbeiten. Alle Befehle arbeiten transparent mit VCFs und BCFs, sowohl unkomprimiert als auch BGZF-komprimiert.

Markierungen: Implementiert in: C, Rolle: Programm

Andere Pakete mit Bezug zu bcftools

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• rec: perl

  Larry Wall's Practical Extraction und Report Language

• rec: python3-gffutils

  Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

• rec: python3-matplotlib

  Python-System ähnlich Matlab zur Ausgabe von Zeichnungen

• sug: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• sug: texlive-latex-recommended

  TeX Live: LaTeX recommended packages

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
arm64	1.20-2+b1	677,4 kB	4.101,0 kB	[Liste der Dateien]