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Paket: perlprimer (1.2.4-2)

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Grafischer Entwurf von Primern für PCR

PerlPrimer ist eine freie grafische Open-Source-Anwendung, geschrieben in Perl, für die Spezifikation von Primern für normale Polymerase-Kettenreaktionen (PCR), Bisulfit-PCR, Echtzeit-PCR (QPCR) und zur Sequenzierung. Sie soll den Entwurfsprozess automatisieren und vereinfachen.

Bei bestehender Internetverbindung wird die Genomdatenbank Ensembl abgefragt, um weitere Informationen über die Genstruktur zu bekommen, also die Lage von Exons und Introns für das Design der Primer zu berücksichtigen. Auch die Sequenzen selbst können abgefragt werden.

Markierungen: Biologie: Clustal/ALN, Proteine, Feld: field::biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:molecular, implemented-in::perl, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, interface::graphical, interface::x11, Vernetzung: Client, Rolle: Programm, Zweck: scope::utility, uitoolkit::tk, Zweck: Analyse, Unterstützt Formate: works-with-format::plaintext, x11::application

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