Quellcode-Paket: bioperl-run (1.7.3-9)
Links für bioperl-run
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Andere Pakete mit Bezug zu bioperl-run
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debhelper-compat
(= 13)
- Paket nicht verfügbar
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libmodule-build-perl
- Rahmenwerk zum Bau und zur Installation von Perl-Modulen
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perl
- Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
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bioperl
(>= 1.7.4)
- Perl-Werkzeuge für bioinformatische Anwendungen
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libalgorithm-diff-perl
- Modul für die Suche nach Unterschieden zwischen Dateien
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- Perl-Modul für laufende Prozesse
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libio-string-perl
- Emuliert die IO::File-Schnittstelle für »in-core«-Zeichenketten
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- Perl-Modul für baumartigen Zugriff auf XML-Dateien
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libfile-sort-perl
- module to sort a file or merge sort multiple files
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- Perl module with the most commonly needed test functions and features
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libarray-compare-perl
- Perl module to easily compare arrays
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libtree-dagnode-perl
- Perl-Basisklasse zur Repräsentation von Knoten in einer Baumstruktur
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libbio-cluster-perl
- BioPerl cluster modules
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libbio-featureio-perl
- Modules for reading, writing, and manipulating sequence features
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libconfig-any-perl
- Modul zum Laden von Konfigurationen von unterschiedlichen Dateiformaten
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- idep:
libbio-tools-run-alignment-clustalw-perl
- Bioperl interface to Clustal W
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libbio-eutilities-perl
- BioPerl interface to the Entrez Programming Utilities (E-utilities)
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- idep:
libbio-tools-run-remoteblast-perl
- Object for remote execution of the NCBI Blast via HTTP
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amap-align
- Protein multiple alignment by sequence annealing
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bedtools
- Hilfswerkzeugsammlung zum Vergleich genomischer Merkmale
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bedtools-test
- test data for the bedtools package
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ncbi-blast+-legacy
- NCBI Blast legacy call script
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- idep:
clustalw
- Globale multiple Alignments von Nukleotid- oder Peptidsequenzen
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- idep:
emboss
- Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie
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- idep:
exonerate
- Generisches Werkzeug zum paarweisen Sequenzvergleich
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- idep:
hmmer
[any-amd64 any-i386 powerpc ppc64]
- Profil-Hidden-Markov-Modelle für Protein-Sequenzanalyse
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- idep:
hyphy-pt
- Hypothesentest unter Verwendung von Phylogenie (pthreads-Version)
- oder
hyphy-mpi
- Hypothesentest unter Verwendung von Phylogenie (MPI-Version)
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- idep:
infernal
[any-amd64 any-i386]
- Rückschluss auf Alignments der RNA-Sekundärstruktur
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- idep:
kalign
- Globales und fortschreitendes multiples Sequenzalignment
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- idep:
mafft
- Programm für multiples Alignment von Aminosäure- oder Nukleotidsequenzen
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muscle
- Multiple alignment program of protein sequences
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ncoils
- coiled coil secondary structure prediction
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phyml
- Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
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primer3
- tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification
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- PROBabilistic CONSistency-based multiple sequence alignment
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python3-pybedtools
- Python 3 wrapper around BEDTools for bioinformatics work
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- Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees
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samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
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- Werkzeug für Alignments von cDNA mit genomischer DNA
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- Generkennung in Genomen von Bakterien und Archaebakterien
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- Vergleich biologischer Polymere, wie DNA- und Protein-Sequenzen
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- phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences
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- highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
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- converts proteins to genomic DNA alignment
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[any-amd64]
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- Einfache und konsistente Schnittstelle zum World Wide Web
