Paket: genomethreader (1.7.3+dfsg-10 und andere) [debports]

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software tool to compute gene structure predictions

GenomeThreader is a software tool to compute gene structure predictions. The gene structure predictions are calculated using a similarity-based approach where additional cDNA/EST and/or protein sequences are used to predict gene structures via spliced alignments. GenomeThreader was motivated by disabling limitations in GeneSeqer, a popular gene prediction program which is widely used for plant genome annotation.

Andere Pakete mit Bezug zu genomethreader

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libexpat1 (>= 2.0.1)

  C-Bibliothek zur XML-Analyse - Laufzeitbibliothek

• dep: libgenometools0t64 (>= 1.6.5+ds)

  Vielseitige Bibliothek für Genomanalysen

• dep: liblua5.1-0

  Laufzeitibliothek für den Lua-Interpreter in Version 5.1

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

genomethreader herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
x32 (inoffizielle Portierung)	1.7.3+dfsg-10+b1	2.051,8 kB	22.248,0 kB	[Liste der Dateien]