Paket: fastqtl (2.184+v7+dfsg-4 und andere) [debports]

[ Quellcode:  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Andere Pakete mit Bezug zu fastqtl

• dep: libblas3

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

  oder libblas.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Iostreams-Bibliothek

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  C++-Bibliothek für Programmoptionen

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

  GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: r-mathlib (>= 4.4.1)

  Eigenständige Mathematikbibliothek für GNU R

• rec: r-cran-argparser

  GNU R command-line argument parser

• rec: r-cran-qvalue

  Paket nicht verfügbar

• rec: r-cran-tools

  Paket nicht verfügbar

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

fastqtl herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
x32 (inoffizielle Portierung)	2.184+v7+dfsg-4+b4	238,8 kB	741,0 kB	[Liste der Dateien]