Paket: twopaco (1.0.0+dfsg-1) [debports]

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build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes

TwoPaCo is an implementation of the algorithm described in the paper "TwoPaCo: An efficient algorithm to build the compacted de Bruijn graph from many complete genomes".

This package contains two programs:

 twopaco: tool for direct construction of the compressed graph from
          multiple complete genomes
 graphdump: utility that turns output of twopaco into a text format

Andere Pakete mit Bezug zu twopaco

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libtbb12 (>= 2021.7.0)

  parallelism library for C++ - runtime files

• dep: libtbbmalloc2 (>= 2021.7.0)

  parallelism helper library for C++ - runtime files

twopaco herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
sparc64 (inoffizielle Portierung)	331,2 kB	3.261,0 kB	[Liste der Dateien]