Paket: soapdenovo2 (242+dfsg-4 und andere)

[ Quellcode: soapdenovo2  ]

Assembler, der Reads zu einem de-novo-Entwurf zusammenfügt

SOAPdenovo ist eine neuartige Methode zum Zusammenfügen kurzer Reads (Sequenzfragmente), mit der ein de-novo-Entwurf für Genome in der Größenordnung des menschlichen Genoms erstellt werden kann. Das Programm wurde speziell für das Zusammenfügen kurzer Sequenzfragmente von Illumina GA entwickelt.

SOAPdenovo schafft neue Möglichkeiten Referenzsequenzen zu bauen und genaue Analysen von nicht erforschten Genomen in einer kosteneffizienten Weise durchzuführen.

Andere Pakete mit Bezug zu soapdenovo2

• dep: libc6 (>= 2.38) [nicht ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libc6.1 (>= 2.36) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht ia64]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libstdc++6 (>= 11) [ia64]

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

  dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nicht ia64]

• dep: libunwind8 [ia64]

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

soapdenovo2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	242+dfsg-4	905,7 kB	1.721,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	242+dfsg-3	968,7 kB	2.902,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	242+dfsg-4	899,4 kB	2.055,0 kB	[Liste der Dateien]