Paket: melting (5.2.0-2)

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Berechnet die Schmelztemperatur eines Nukleinsäure-Doppelhelix

Dieses Programm berechnet für einen Nukleinsäure-Doppelhelix die Enthalpie, die Entropie und die Schmelztemperatur der Helix-Coil-Übergange. Drei Arten von Hybridisierungen sind möglich: DNA/DNA, DNA/RNA und RNA/RNA. Das Programm berechnet zuerst die Hybridisierungsenthalpie und -entropie aus den elementaren Parametern eines jeden Basenpaares durch die Nearest-Neighbor-Methode. Danach wird die Schmelztemperatur berechnet. Der Satz an thermodynamischen Parametern kann leicht geändert werden, etwa nach einem experimentellen Durchbruch.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, field::biology:molecular, implemented-in::c, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: role::program, scope::utility, Anwendungs-Suite: GNU, Zweck: use::analysing, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu melting

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: default-jre

Standard Java or Java compatible Runtime

oder java-runtime

virtuelles Paket, bereitgestellt durch default-jre, openjdk-11-jre, openjdk-19-jre, openjdk-20-jre
dep: java-wrappers

Wrapper für ausführbare Java-Programme

sug: melting-gui

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