Alle Optionen
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Quellcode: libedlib  ]

Paket: python3-edlib (1.2.7-6 und andere)

Links für python3-edlib

Screenshot

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket libedlib herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Ähnliche Pakete:

library for sequence alignment using edit distance (Python3 module)

A lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance.

Calculating edit distance of two strings is as simple as:

 edlibAlign("hello", 5, "world!", 6,
            edlibDefaultAlignConfig()).editDistance;
Features

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

This package contains the Python3 module.

Andere Pakete mit Bezug zu python3-edlib

  • hängt ab von
  • empfiehlt
  • schlägt vor
  • erweitert

python3-edlib herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur Version Paketgröße Größe (installiert) Dateien
alpha (inoffizielle Portierung) 1.2.7-6+b3 61,8 kB217,0 kB [Liste der Dateien]
amd64 1.2.7-6+b3 66,8 kB192,0 kB [Liste der Dateien]
arm64 1.2.7-6+b3 59,5 kB216,0 kB [Liste der Dateien]
armel 1.2.7-6+b3 57,6 kB214,0 kB [Liste der Dateien]
armhf 1.2.7-6+b3 59,3 kB150,0 kB [Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung) 1.2.7-6+b3 64,9 kB185,0 kB [Liste der Dateien]
i386 1.2.7-6+b3 68,1 kB194,0 kB [Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung) 1.2.7-5 108,5 kB604,0 kB [Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung) 1.2.7-6+b3 64,5 kB216,0 kB [Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung) 1.2.7-6+b3 58,7 kB173,0 kB [Liste der Dateien]
mips64el 1.2.7-6+b3 59,9 kB222,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung) 1.2.7-6+b3 64,8 kB280,0 kB [Liste der Dateien]
ppc64el 1.2.7-6+b3 66,8 kB216,0 kB [Liste der Dateien]
riscv64 1.2.7-6+b3 64,0 kB148,0 kB [Liste der Dateien]
s390x 1.2.7-6+b3 65,0 kB196,0 kB [Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung) 1.2.7-6+b3 77,8 kB214,0 kB [Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung) 1.2.7-6+b3 56,7 kB1.052,0 kB [Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung) 1.2.7-5+b1 63,9 kB170,0 kB [Liste der Dateien]