Paket: python3-cobra (0.29.1-1 und andere)

[ Quellcode: python-cobra  ]

constraint-based modeling of biological networks with Python 3

COnstraint-Based Reconstruction and Analysis (COBRA) methods are widely used for genome-scale modeling of metabolic networks in both prokaryotes and eukaryotes. COBRApy is a constraint-based modeling package that is designed to accommodate the biological complexity of the next generation of COBRA models and provides access to commonly used COBRA methods, such as flux balance analysis, flux variability analysis, and gene deletion analyses.

Andere Pakete mit Bezug zu python3-cobra

• dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64, sh4]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [m68k, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.26) [ia64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: libglpk40 (>= 4.59) [ia64, m68k, riscv64, sh4, sparc64]

  linear programming kit with integer (MIP) support

• dep: python-cobra-data (= 0.14.1-1) [alpha, hppa, x32]

  constraint-based modeling of biological networks (data)

  dep: python-cobra-data (= 0.29.0-1) [ppc64]

  dep: python-cobra-data (= 0.29.1-1) [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el]

  dep: python-cobra-data (= 0.5.9-1) [ia64, m68k, riscv64, sh4, sparc64]

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.7) [ia64, riscv64, sparc64]

  dep: python3 (<< 3.8) [m68k, sh4]

  dep: python3 (>= 3.5~) [sparc64]

  dep: python3 (>= 3.6~) [ia64, m68k, riscv64, sh4]

• dep: python3-appdirs (<< 2) [ppc64]

  determining appropriate platform-specific directories (Python 3)

  dep: python3-appdirs (>= 1.4) [ppc64]

• dep: python3-depinfo [nicht ia64, m68k, riscv64, sh4, sparc64]

  retrieve and print Python 3 package dependencies

• dep: python3-diskcache [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el]

  Python3 module for disk and file backed persistent cache

• dep: python3-future [alpha, hppa, x32]

  Paket nicht verfügbar

• dep: python3-httpx [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el]

  next generation HTTP client

• dep: python3-importlib-resources [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el]

  Read resources from Python packages

• dep: python3-numpy [nicht ia64, m68k, riscv64, sh4, sparc64]

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: python3-optlang [alpha, hppa, x32]

  sympy based mathematical programming language (Python 3)

  dep: python3-optlang (>= 1.7.0-1~) [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el]

• dep: python3-pandas [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el]

  data structures for "relational" or "labeled" data

  dep: python3-pandas (>= 0.17.0) [alpha, hppa, x32]

• dep: python3-platformdirs [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el]

  Bestimmung geeigneter plattformspezifischer Verzeichnisse (Python 3)

• dep: python3-pydantic [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el]

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• dep: python3-rich [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el]

  render rich text, tables, progress bars, syntax highlighting, markdown and more

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• dep: python3-simplejson [ppc64]

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• dep: python3-six [alpha, hppa, ia64, m68k, riscv64, sh4, sparc64, x32]

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• dep: python3-swiglpk [alpha, hppa, x32]

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  dep: python3-swiglpk (>= 5.0.8-1~) [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el]

• dep: python3-tabulate [nicht ia64, m68k, riscv64, sh4, sparc64]

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• rec: python3-numpy [nicht alpha, hppa, x32]

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  Wissenschaftliche Werkzeuge für Python 3

• rec: python3-simplejson [alpha, hppa, x32]

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• sug: python3-matplotlib

  Python-System ähnlich Matlab zur Ausgabe von Zeichnungen

• sug: qsopt-ex

  Exact linear programming solver

python3-cobra herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	0.14.1-1	101,3 kB	536,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	0.29.1-1	1.093,0 kB	1.877,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	0.29.1-1	1.093,0 kB	1.877,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	0.29.1-1	1.093,0 kB	1.877,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	0.29.1-1	1.093,0 kB	1.877,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	0.14.1-1	101,3 kB	536,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	0.29.1-1	1.093,0 kB	1.877,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	0.5.9-1	173,0 kB	989,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	0.5.9-1+b2	166,3 kB	918,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	0.29.1-1	1.093,0 kB	1.877,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	0.29.0-1	1.092,6 kB	1.875,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	0.29.1-1	1.093,0 kB	1.877,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64 (inoffizielle Portierung)	0.5.9-1	154,5 kB	703,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	0.5.9-1+b2	185,4 kB	846,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	0.5.9-1+b1	161,6 kB	1.016,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	0.14.1-1	101,3 kB	536,0 kB	[Liste der Dateien]