Paket: prime-phylo (1.0.11-12)

[ Quellcode: prime-phylo  ]

bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account

PrIME (Probabilistic Integrated Models of Evolution) is a package supporting inference of evolutionary parameters in a Bayesian framework using Markov chain Monte Carlo simulation. A distinguishing feature of PrIME is that the species tree is taken into account when analyzing gene trees.

The input data to PrIME is a multiple sequence alignment in FASTA format and the output data contains trees in Newick format.

Andere Pakete mit Bezug zu prime-phylo

• dep: libblas3

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

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  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

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  C++ interface to the Message Passing Interface (MPI)

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• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
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  oder liblapack.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

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• dep: libxml2 (>= 2.7.4)

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• dep: perl

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ppc64el	821,5 kB	3.830,0 kB	[Liste der Dateien]