[ Quellcode: arden ]
Paket: arden (1.0-6)
Links für arden
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket arden herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Étienne Mollier (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [sourceforge.net]
Ähnliche Pakete:
Genaue Kontrolle für das Lesen von Alignierungen unter Verwendung einer künstlichen Intelligenz
ARDEN (Artificial Reference Driven Estimation of false positives in NGS data) ist für DNA-Sequenzierung der nächsten Generation ein neuartiges Bewertungsprogramm zum Abschätzen von Fehlerraten basierend auf experimentell gewonnenen DNA-Fragmenten (reads) und einem zusätzlich generierten künstlichem Genom. Es ermöglicht die Berechnung von Fehlerraten von einem spezifizierten Datensatz und die Konstruktion einer ROC-Kurve. Nebenbei kann es für die Optimierung von Parametern für read mappers, zur Auswahl von read mappers für ein spezifisches Problem oder zum Filtern von Alignierungen basierend auf Qualitätsabschätzungen genutzt werden.
Andere Pakete mit Bezug zu arden
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
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- dep: python3-htseq
- Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities
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- dep: python3-matplotlib
- Python-System ähnlich Matlab zur Ausgabe von Zeichnungen
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- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
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- dep: python3-scipy
- Wissenschaftliche Werkzeuge für Python 3
arden herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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| all | 88,0 kB | 1.161,0 kB | [Liste der Dateien] |