Paket: apbs (3.4.1-5.1 und andere)
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Externe Ressourcen:
- Homepage [www.poissonboltzmann.org]
Ähnliche Pakete:
Adaptive Poisson Boltzmann Solver
APBS is a software package for the numerical solution of the Poisson-Boltzmann equation (PBE), one of the most popular continuum models for describing electrostatic interactions between molecular solutes in salty, aqueous media. Continuum electrostatics plays an important role in several areas of biomolecular simulation, including:
* simulation of diffusional processes to determine ligand-protein and protein-protein binding kinetics, * implicit solvent molecular dynamics of biomolecules , * solvation and binding energy calculations to determine ligand-protein and protein-protein equilibrium binding constants and aid in rational drug design, * and biomolecular titration studies.
APBS was designed to efficiently evaluate electrostatic properties for such simulations for a wide range of length scales to enable the investigation of molecules with tens to millions of atoms.
This package contains the apbs program and utilities.
Andere Pakete mit Bezug zu apbs
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- dep: apbs-data (= 3.4.1-5.1)
- data files for APBS (Adaptive Poisson Boltzmann Solver)
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- dep: libamd3 (>= 1:7.0.1)
- Bibliothek für eine Näherung an eine Minimalgrad-Ordnung für schwach besetzte Matrizen
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- dep: libapbs3t64 (= 3.4.1-5.1+b3)
- Adaptive Poisson Boltzmann Solver
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- dep: libarpack2t64 (>= 2.1)
- Fortran77-Subroutinen für die Lösung großer Eigenwertprobleme
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- dep: libblas3
- Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek
- oder libblas.so.3
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libcamd3 (>= 1:7.0.1)
- Bibliothek für ungefähren symmetrischen Minimalgrad für schwach besetzte Matrizen
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- dep: libccolamd3 (>= 1:7.0.1)
- »Constrained COLumn Approximate Minimum Degree ordering« für schwach besetzte Matrizen
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- dep: libcholmod5 (>= 1:7.3.1)
- sparse Cholesky factorization library for sparse matrices
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- dep: libcolamd3 (>= 1:7.0.1)
- Bibliothek mit dem COLAMD-Algorithmus für schwach besetzte Matrizen
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- dep: libfetk1.9t64 (>= 3.4.1)
- FETK libraries for APBS (shared libraries)
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- dep: libgomp1 (>= 4.2.1)
- Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
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- dep: libjs-mathjax
- JavaScript-Engine zur Anzeige von LaTeX und MathML
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- dep: libmaloc1 (>= 0.2-1)
- Object-oriented Abstraction Layer for C
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- dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)
- Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken
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- dep: libspqr4 (>= 1:7.7.0+dfsg)
- sparse QR factorization library
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- dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
-
- dep: libsuitesparseconfig7 (>= 1:7.0.1)
- Konfigurationsroutinen für alle SuiteSparse-Module
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- dep: libsuperlu6 (>= 6.0.1+dfsg1)
- Direct solution of large, sparse systems of linear equations
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- dep: libumfpack6 (>= 1:7.0.1)
- sparse LU factorization library
apbs herunterladen
Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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ppc64el | 3.4.1-5.1+b3 | 80,8 kB | 1.253,0 kB | [Liste der Dateien] |