Paket: hmmer (3.4+dfsg-2) [debports]

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Profil-Hidden-Markov-Modelle für Protein-Sequenzanalyse

HMMER ist eine Implementierung der Profile-Hidden-Markov-Modelle für eine sensitive Suche in biologischen Sequenzdatenbanken mit multiplen Sequenzalignments als Anfragen.

Mit einem multiplen Sequenzalignment als Eingabe baut HMMER ein statistisches Modell, genannt »Hidden-Markov-Modell«. Mit diesem kann in Sequenzdatenbanken nach homologen Sequenzen gesucht werden. Dabei können gleichzeitig, der gesuchten Proteinfamilie zugehörige, Sequenzen alignt werden.

Andere Pakete mit Bezug zu hmmer

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

fast suffix array construction

sug: hmmer-doc (>= 3.4+dfsg-2)

profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.011,3 kB	6.929,0 kB	[Liste der Dateien]