Paket: bcalm (2.2.3-5 und andere) [debports]

[ Quellcode:  ]

de Bruijn compaction in low memory

A bioinformatics tool for constructing the compacted de Bruijn graph from sequencing data.

This is the parallel version of the BCALM software using gatb-core library.

Andere Pakete mit Bezug zu bcalm

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg)

  dynamic library of the Genome Analysis Toolbox

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3)

  Hierarchisches Datenformat 5 (HDF5) - C-Laufzeitdateien - serielle Version

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

bcalm herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ppc64 (inoffizielle Portierung)	2.2.3-5+b2	34,6 kB	144,0 kB	[Liste der Dateien]