Paket: r-cran-tcr (2.3.2+ds-1)

[ Quellcode: r-cran-tcr  ]

Advanced Data Analysis of Immune Receptor Repertoires

Cells of the immune system are the grand exception to the rule that all cells of an individuum have (mostly exact) copies of the same DNA. B cells (which produce antibodies) and T cells (which communicate with cells) however have a section of their DNA with genes of the groups V, D and J that are reorganised within the genomic DNA to provide the flexibility to deal with yet unknown pathogens.

This package provides a platform for the advanced analysis of T cell receptor repertoire data and its visualisations.

Caveat: This package is soon to be replaced by http://github.com/immunomind/immunarch which is not yet available as a Debian package.

Andere Pakete mit Bezug zu r-cran-tcr

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: r-api-4.0

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.0.1-1)

  GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern

• dep: r-cran-data.table (>= 1.9.0)

  GNU R - Erweiterung von data.frame()

• dep: r-cran-dplyr (>= 0.4.0)

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-ggplot2 (>= 1.0.0)

  Implementierung der »Grammar of Graphics«

• dep: r-cran-gridextra (>= 0.9.0)

  GNU R: Erweiterungen für das grid-Paket

• dep: r-cran-gtable (>= 0.1.2)

  Arrange grobs in tables

• dep: r-cran-igraph (>= 0.7.1)

  GNU R network analysis and visualization

• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.1)

  GNU-R-Paket für die nahtlose Verflechtung von R und C++

• dep: r-cran-reshape2 (>= 1.2.0)

  Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

• dep: r-cran-scales (>= 0.3.0)

  Skalierungsfunktionen zur Visualisierung

• dep: r-cran-stringdist (>= 0.7.3)

  GNU R approximate string matching and string distance functions

• sug: r-cran-knitr (>= 1.8)

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown (>= 1.0)

  Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate

• sug: r-cran-roxygen2 (>= 3.0.0)

  in-line documentation for GNU R

r-cran-tcr herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
mips64el	1.910,1 kB	2.127,0 kB	[Liste der Dateien]