[ Quellcode: hmmer2 ]
Paket: hmmer2 (2.3.2+dfsg-12 und andere)
Links für hmmer2
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket hmmer2 herunterladen:
Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [hmmer.janelia.org]
Ähnliche Pakete:
Profil-Hidden-Markov-Modelle für Protein-Sequenzanalyse
HMMER ist eine Implementierung der Profile-Hidden-Markov-Modelle für eine sensitive Suche in biologischen Sequenzdatenbanken mit multiplen Sequenzalignments als Anfragen.
Mit einem multiplen Sequenzalignment als Eingabe baut HMMER ein statistisches Modell, genannt »Hidden-Markov-Modell«. Mit diesem kann in Sequenzdatenbanken nach homologen Sequenzen gesucht werden. Dabei können gleichzeitig, der gesuchten Proteinfamilie zugehörige, Sequenzen alignt werden.
Andere Pakete mit Bezug zu hmmer2
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libsquid1t64 (>= 1.9g+cvs20050121)
- biosquid dynamic library for biological sequence analysis
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- rec: biosquid
- Hilfsprogramme für die biologische Sequenzanalyse
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- sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-12)
- profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)
hmmer2 herunterladen
| Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|---|
| mips64el | 2.3.2+dfsg-12+b1 | 304,6 kB | 2.462,0 kB | [Liste der Dateien] |