Paket: blasr (5.3.3+dfsg-1 und andere) [debports]

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mapping single-molecule sequencing reads

Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.

Andere Pakete mit Bezug zu blasr

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc2 (>= 4.2.1)

  Paket nicht verfügbar

• dep: libhdf5-cpp-103 (>= 1.10.1)

  Hierarchisches Datenformat 5 (HDF5) - C++-Laufzeitdateien - serielle Version, Übergangspaket

• dep: libpbbam0.23.0 (>= 0.23.0+dfsg)

  Paket nicht verfügbar

• dep: libpbseq

  library for analyzing PacBio sequencing data

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

blasr herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
m68k (inoffizielle Portierung)	5.3.3+dfsg-1+b1	180,6 kB	591,0 kB	[Liste der Dateien]