Paket: ray (2.3.1-8 und andere) [debports]

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De-novo-Genomassemblierung von »Next Generation Sequencing«-Daten

Ray ist eine Parallelsoftware zur Berechnung von De-novo-Genomassemblierungen mithilfe von durch Next Generation Sequencing gewonnenen Daten. Die Software ist in C++ geschrieben und kann parallel auf mehreren miteinander verbundenen Computern laufen. Sie nutzt den MPI-Standard (message-passing interface).

Ray beinhaltet:

 - Ray        De-novo-Assemblierung einzelner Genome
 - Ray Méta   De-novo-Assemblierung von Metagenomen
 - Ray Communities  Mikrobenfülle + taxonomisches Profiling
 - Ray Ontologies   Gen-Ontologie-Profiling

Andere Pakete mit Bezug zu ray

• dep: libbz2-1.0

  Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libopenmpi3t64 (>= 4.1.6)

  Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libunwind8

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: mpi-default-bin

  Standard-MPI-Laufzeitdateien (Metapaket)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ia64 (inoffizielle Portierung)	2.3.1-8+b1	952,8 kB	4.388,0 kB	[Liste der Dateien]