Paket: rampler (2.1.1-1) [debports]

[ Quellcode:  ]

module for sampling genomic sequences

Standalone module for sampling genomic sequences. It supports two modes, random subsampling of sequencer data to a desired depth (given the reference length) and file splitting to desired size in bytes.

Rampler takes as first input argument a file in FASTA/FASTQ format which can be compressed with gzip. The rest of input parameters depend on the mode of operation. The output is stored into a file(s) which is in the same format as the input file but uncompressed.

Andere Pakete mit Bezug zu rampler

• dep: libc6.1 (>= 2.36)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libunwind8

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

rampler herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ia64 (inoffizielle Portierung)	26,0 kB	96,0 kB	[Liste der Dateien]