Paket: r-cran-sctransform (0.4.1-1) [debports]

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Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI Data

A normalization method for single-cell UMI count data using a variance stabilizing transformation. The transformation is based on a negative binomial regression model with regularized parameters. As part of the same regression framework, this package also provides functions for batch correction, and data correction. See Hafemeister and Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for more details.

Andere Pakete mit Bezug zu r-cran-sctransform

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• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

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• dep: liblapack3

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• dep: r-cran-ggplot2

  Implementierung der »Grammar of Graphics«

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• dep: r-cran-matrixstats

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• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

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• dep: r-cran-reshape2

  Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

• dep: r-cran-rlang

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• rec: r-cran-irlba

  GNU R fast truncated SVD, PCA and symmetric eigendecomposition

• rec: r-cran-knitr

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• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

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