Paket: ntcard (1.2.2+dfsg-4) [debports]

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Streaming algorithm to estimate cardinality in genomics datasets

As input it takes file(s) in fasta, fastq, sam, or bam formats and computes the total number of distinct k-mers, F0, and also the k-mer coverage frequency histogram, fi, i>=1.

Andere Pakete mit Bezug zu ntcard

• dep: libc6.1 (>= 2.35)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: libunwind8

  Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ia64 (inoffizielle Portierung)	47,4 kB	230,0 kB	[Liste der Dateien]