Paket: elph (1.0.1-5) [debports]

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Homepage [www.cbcb.umd.edu]

DNA/protein sequence motif finder

ELPH (Estimated Locations of Pattern Hits) is a general-purpose Gibbs sampler for finding motifs in a set of DNA or protein sequences. The program takes as input a set containing anywhere from a few dozen to thousands of sequences, and searches through them for the most common motif, assuming that each sequence contains one copy of the motif. ELPH was used to find patterns such as ribosome binding sites (RBSs) and exon splicing enhancers (ESEs).

Andere Pakete mit Bezug zu elph

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6.1 (>= 2.30)

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

GCC Support-Bibliothek
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
ia64 (inoffizielle Portierung)	68,2 kB	265,0 kB	[Liste der Dateien]