Paket: dnaclust (3-7 und andere)

[ Quellcode: dnaclust  ]

tool for clustering millions of short DNA sequences

dnaclust is a tool for clustering large number of short DNA sequences. The clusters are created in such a way that the "radius" of each clusters is no more than the specified threshold.

The input sequences to be clustered should be in Fasta format. The id of each sequence is based on the first word of the seqeunce in the Fasta format. The first word is the prefix of the header up to the first occurrence of white space characters in the header.

Markierungen: Biologie: Fasta/Pearson, Nukleinsäuren, Feld: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementiert in: C++, Rolle: role::program, works-with::biological-sequence

Andere Pakete mit Bezug zu dnaclust

• dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

  C++-Bibliothek für Programmoptionen

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
i386	3-7+b3	115,6 kB	678,0 kB	[Liste der Dateien]