Paket: r-bioc-deseq2 (1.42.1+dfsg-1) [debports]

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R package for RNA-Seq Differential Expression Analysis

Differential gene expression analysis based on the negative binomial distribution. Estimate variance-mean dependence in count data from high-throughput sequencing assays and test for differential expression based on a model using the negative binomial distribution.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-deseq2

• dep: libblas3

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• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1)

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• dep: liblapack3

  Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

  oder liblapack.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

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  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core

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• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.1.6)

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• dep: r-cran-ggplot2 (>= 3.4.0)

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• dep: r-cran-locfit

  GNU R local regression, likelihood and density estimation

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• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

  GNU-R-Paket für die nahtlose Verflechtung von R und C++

• dep: r-cran-rcpparmadillo

  GNU R package for Armadillo C++ linear algebra library

• sug: r-bioc-glmgampoi

  GNU R fit a Gamma-Poisson generalized linear model

• sug: r-bioc-tximeta

  Transcript Quantification Import with Automatic Metadata

• sug: r-bioc-tximport

  transcript-level estimates for biological sequencing

• sug: r-bioc-tximportdata

  GNU R various transcript abundance quantifiers

• sug: r-cran-biocmanager

  access the Bioconductor project package repository

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-pbapply

  GNU R package providing progress bars for vectorized R functions

• sug: r-cran-pheatmap

  GNU R package to create pretty heatmaps

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  GNU R package providing suitable color palettes

• sug: r-cran-readr

  GNU R package to read rectangular text data

• sug: r-cran-rmarkdown

  Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

r-bioc-deseq2 herunterladen

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
hppa (inoffizielle Portierung)	1.234,4 kB	1.718,0 kB	[Liste der Dateien]