Paket: uncalled (2.3+ds-2)

[ Quellcode: uncalled  ]

Utility for Nanopore Current Alignment to Large Expanses of DNA

Streaming algorithm for mapping raw nanopore signal to DNA references

Enables real-time enrichment or depletion on Oxford Nanopore Technologies (ONT) MinION runs via ReadUntil.

Also supports standalone signal mapping of fast5 reads

Andere Pakete mit Bezug zu uncalled

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libhdf5-103-1t64

  Hierarchisches Datenformat 5 (HDF5) - C-Laufzeitdateien - serielle Version

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-numpy

  Fast array facility to the Python language (Python 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
armel	518,5 kB	1.697,0 kB	[Liste der Dateien]