Paket: r-cran-bio3d (2.4-4-1)

[ Quellcode: r-cran-bio3d  ]

GNU-R-Paket für biologische Strukturanalyse

Das Paket bio3d bietet Methoden zur Verarbeitung, Organisation und interaktiven Untersuchung von Daten zu Protein-Struktur, -Sequenz und -Dynamik. Dies beinhaltet Funktionen zum Lesen und Schreiben von Strukturen, Sequenzen und den Trajektorien der Moleküldynamik, die Zusammenfassung von Informationen zu Atomen, deren Selektion, Ausrichtung, Überlagerung, rigid core identification, Clustering, Winkel-Untersuchung, Untersuchungen von Distanz-Matrizen, Betrachtung der Erhaltung von Struktur und Sequenz und die Hauptkomponentenanalyse. Zudem werden vielfältige Anpassungen angeboten, um auf die mächtigen Funktionen zur Statistik und der graphischen Repräsentation von GNU R zurückgreifen zu können.

Andere Pakete mit Bezug zu r-cran-bio3d

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: r-api-4.0

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.2.1-3)

  GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern

• dep: r-cran-rcpp

  GNU-R-Paket für die nahtlose Verflechtung von R und C++

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

• rec: clustalo

  General-purpose multiple sequence alignment program for proteins

• rec: dssp

  protein secondary structure assignment based on 3D structure

• rec: muscle

  Multiple alignment program of protein sequences

• rec: mustang

  Struktur-Alignment mehrerer Proteine

• rec: r-cran-testthat (>= 0.9.1)

  GNU R testsuite

• sug: r-bioc-biostrings

  GNU R string objects representing biological sequences

• sug: r-cran-bigmemory

  Manage Massive Matrices with Shared Memory and Memory-Mapped Files

• sug: r-cran-httr

  GNU R tools for working with URLs and HTTP

• sug: r-cran-igraph

  GNU R network analysis and visualization

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-lattice

  GNU-R-Paket für »Trellis«-Grafiken

• sug: r-cran-ncdf4

  GNU R interface to Unidata netCDF format data files

• sug: r-cran-rcurl

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• sug: r-cran-rmarkdown

  Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate

• sug: r-cran-xml

  GNU R package for XML parsing and generation

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
armel	2.866,9 kB	3.910,0 kB	[Liste der Dateien]