Paket: simka (1.5.3-8 und andere) [debports]

[ Quellcode:  ]

comparative metagenomics method dedicated to NGS datasets

Simka is a de novo comparative metagenomics tool. Simka represents each dataset as a k-mer spectrum and compute several classical ecological distances between them.

Andere Pakete mit Bezug zu simka

• dep: libc6.1 (>= 2.38)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg)

  dynamic library of the Genome Analysis Toolbox

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3)

  Hierarchisches Datenformat 5 (HDF5) - C-Laufzeitdateien - serielle Version

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

simka herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.5.3-8+b2	411,5 kB	2.860,0 kB	[Liste der Dateien]