Paket: sigma-align (1.1.3-9) [debports]

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Einfache multiple Alignments nicht-kodierender DNA-Sequenzen

Sigma (»Simple greedy multiple alignment«) ist ein Alignment-Programm. Der Algorithmus und das Scoring-Schema sind speziell für nicht-kodierende DNA-Sequenzen entworfen.

Das Programm verwendet die Strategie des Suchens der bestmöglichen lückenlosen lokalen Alignments. Dies passiert bei jedem Schritt indem ein bestmögliches Alignment passend zu existierenden Alignments ermittelt wird. Sigma bewertet die Signifikanz der Alignments basierend auf den Längen der alignierten Fragmente und eines Hintergrundmodells. Diese können über eine Hilfsdatei intergenischer DNA zur Verfügung gestellt oder geschätzt werden.

Andere Pakete mit Bezug zu sigma-align

• dep: libc6.1 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

• dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.12.0)

  GLib - Bibliothek von C-Routinen

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