Paket: r-cran-bio3d (2.4-4-1) [debports]
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GNU-R-Paket für biologische Strukturanalyse
Das Paket bio3d bietet Methoden zur Verarbeitung, Organisation und interaktiven Untersuchung von Daten zu Protein-Struktur, -Sequenz und -Dynamik. Dies beinhaltet Funktionen zum Lesen und Schreiben von Strukturen, Sequenzen und den Trajektorien der Moleküldynamik, die Zusammenfassung von Informationen zu Atomen, deren Selektion, Ausrichtung, Überlagerung, rigid core identification, Clustering, Winkel-Untersuchung, Untersuchungen von Distanz-Matrizen, Betrachtung der Erhaltung von Struktur und Sequenz und die Hauptkomponentenanalyse. Zudem werden vielfältige Anpassungen angeboten, um auf die mächtigen Funktionen zur Statistik und der graphischen Repräsentation von GNU R zurückgreifen zu können.
Andere Pakete mit Bezug zu r-cran-bio3d
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- dep: libc6.1 (>= 2.1.3)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC Support-Bibliothek
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
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- dep: r-api-4.0
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core
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- dep: r-base-core (>= 4.2.1-3)
- GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern
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- dep: r-cran-rcpp
- GNU-R-Paket für die nahtlose Verflechtung von R und C++
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
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- rec: clustalo
- General-purpose multiple sequence alignment program for proteins
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- rec: dssp
- protein secondary structure assignment based on 3D structure
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- rec: muscle
- Multiple alignment program of protein sequences
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- rec: mustang
- Struktur-Alignment mehrerer Proteine
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- rec: r-cran-testthat (>= 0.9.1)
- GNU R testsuite
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- sug: r-bioc-biostrings
- GNU R string objects representing biological sequences
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- sug: r-cran-bigmemory
- Manage Massive Matrices with Shared Memory and Memory-Mapped Files
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- sug: r-cran-httr
- GNU R tools for working with URLs and HTTP
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- sug: r-cran-igraph
- GNU R network analysis and visualization
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- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
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- sug: r-cran-lattice
- GNU-R-Paket für »Trellis«-Grafiken
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- sug: r-cran-ncdf4
- GNU R interface to Unidata netCDF format data files
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- sug: r-cran-rcurl
- GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface
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- sug: r-cran-rmarkdown
- Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate
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- sug: r-cran-xml
- GNU R package for XML parsing and generation
r-cran-bio3d herunterladen
Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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alpha (inoffizielle Portierung) | 2.873,8 kB | 4.040,0 kB | [Liste der Dateien] |