Paket: r-bioc-hdf5array (1.34.0-1 und andere) [debports]

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Experimentelles Paket

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HDF5 backend for DelayedArray objects

Implements the HDF5Array and TENxMatrix classes, 2 convenient and memory-efficient array-like containers for on-disk representation of HDF5 datasets. HDF5Array is for datasets that use the conventional (i.e. dense) HDF5 representation. TENxMatrix is for datasets that use the HDF5-based sparse matrix representation from 10x Genomics (e.g. the 1.3 Million Brain Cell Dataset). Both containers being DelayedArray extensions, they support all operations supported by DelayedArray objects. These operations can be either delayed or block-processed.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-hdf5array

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libhdf5-310 (>= 1.14.4.3)

  Hierarchisches Datenformat 5 (HDF5) - C-Laufzeitdateien - serielle Version

• dep: libhdf5-hl-310

  Hierarchisches Datenformat 5 (HDF5) - High-Level-Laufzeitdateien - serielle Version

• dep: r-api-4.0

  Paket nicht verfügbar

• dep: r-api-bioc-3.20

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.51.2)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-delayedarray (>= 0.31.8)

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-iranges

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-rhdf5 (>= 2.31.6)

  BioConductor HDF5 interface to R

• dep: r-bioc-rhdf5filters

  GNU R HDF5 compression filters

• dep: r-bioc-rhdf5lib

  GNU R hdf5 library

• dep: r-bioc-s4arrays (>= 1.1.1)

  foundation of array-like containers in Bioconductor

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.13)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-sparsearray (>= 1.5.42)

  efficient in-memory representation of multidimensional sparse arrays

• dep: r-cran-matrix

  GNU R - Paket von Klassen für dicht und dünn besetzte Matrizen

• sug: r-bioc-biocparallel

  BioConductor facilities for parallel evaluation

• sug: r-bioc-delayedmatrixstats

  Functions on Rows and Columns of 'DelayedMatrix' Objects

• sug: r-bioc-experimenthub

  BioConductor client to access ExperimentHub resources

• sug: r-bioc-genefilter

  methods for filtering genes from microarray experiments

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-genomicranges

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• sug: r-bioc-singlecellexperiment

  S4 Classes for Single Cell Data

• sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.15.1)

  BioConductor assay container

• sug: r-cran-runit

  GNU-R-Paket, das ein Programmiergerüst für Komponententests bereitstellt

r-bioc-hdf5array herunterladen

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Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.34.0-1+b1	8.569,6 kB	9.962,0 kB	[Liste der Dateien]