Paket: fml-asm (0.1+git20190320.b499514-2~0exp) [debports]

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Experimentelles Paket

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tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Andere Pakete mit Bezug zu fml-asm

• dep: libatomic1 (>= 4.8)

  Hilfsbibliothek, die atomare (__atomic) Built-in-Funktionen zur Verfügung stellt

• dep: libc6 (>= 2.36)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
sh4 (inoffizielle Portierung)	91,4 kB	210,0 kB	[Liste der Dateien]