[ Quellcode: libssw ]
Paket: ssw-align (1.2.5-1)
Links für ssw-align
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket libssw herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Sascha Steinbiss (QS-Seite)
- Michael R. Crusoe (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
Experimentelles Paket
Warnung: Dieses Paket stammt aus der Experimental-Distribution. Dies bedeutet, dass es höchstwahrscheinlich instabil oder fehlerhaft ist und sogar Datenverlust verursachen kann. Bitte lesen Sie den Changelog und andere möglicherweise verfügbare Dokumentation, bevor Sie es benutzen.
Smith-Waterman aligner based on libssw
This package provides a command-line aligner based on the libssw library, a fast SIMD accelerated implementation of the Smith-Waterman algorithm. The input files can be in FASTA or FASTQ format. Both target and query files can contain multiple sequences. Each sequence in the query file will be aligned with all sequences in the target file. Output is provided in SAM or BLAST-like text format.
Andere Pakete mit Bezug zu ssw-align
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libssw1 (= 1.2.5-1)
- fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
ssw-align herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| i386 | 23,5 kB | 71,0 kB | [Liste der Dateien] |