Paket: arden (1.0-4)

[ Quellcode: arden  ]

Genaue Kontrolle für das Lesen von Alignierungen unter Verwendung einer künstlichen Intelligenz

ARDEN (Artificial Reference Driven Estimation of false positives in NGS data) ist für DNA-Sequenzierung der nächsten Generation ein neuartiges Bewertungsprogramm zum Abschätzen von Fehlerraten basierend auf experimentell gewonnenen DNA-Fragmenten (reads) und einem zusätzlich generierten künstlichem Genom. Es ermöglicht die Berechnung von Fehlerraten von einem spezifizierten Datensatz und die Konstruktion einer ROC-Kurve. Nebenbei kann es für die Optimierung von Parametern für read mappers, zur Auswahl von read mappers für ein spezifisches Problem oder zum Filtern von Alignierungen basierend auf Qualitätsabschätzungen genutzt werden.

Andere Pakete mit Bezug zu arden

• dep: python

  Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python2-Version)

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  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-htseq

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  Numerical Python fügt der Sprache Python eine schnelle Array-Einrichtung hinzu

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  wissenschaftliche Werkzeuge für Python

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