Paket: mipe (1.1-7)

[ Quellcode: mipe  ]

Werkzeuge zum Speichern von PCR-abgeleiteten Daten

MIPE bietet ein Standardformat zum Austausch und/oder Speichern aller Daten, die mit PCR-Experimenten zusammenhängen, wobei eine einfache Textdatei verwendet wird. Dies erlaubt:

 * den Austausch von PCR-Daten zwischen Forschern/Laboren
 * eine Rückverfolgbarkeit von Daten
 * Vermeidung von Problemen beim Veröffentlichen der Daten zum dbSTS
   oder dbSNP
 * das Schreiben von Standardskripten, um Daten zu extrahieren (z.B. eine
   Liste aller PCR-Primer, SNP-Positionen oder Haplotypen
   unterschiedlicher Tiere)

Obwohl dieses Werkzeug für die Datenspeicherung verwendet werden kann, liegt der primäre Fokus auf dem Datenaustausch. Für die Speicherung größerer Datenmengen sind relationale Datenbanken geeigneter. Das MIPE-Format könnte in dem Fall als Standardformat zum Im- und/oder Export in/aus diesen Datenbanken dienen.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, field::biology:molecular, implemented-in::perl, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: role::TODO, role::documentation, Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::organizing, works-with-format::xml, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu mipe

• dep: libxml-perl

  Perlmodule für XML

• dep: libxml-twig-perl

  Perl-Modul für Baum-artigen Zugriff auf XML-Dateien

• dep: perl

  Larry Wall's Practical Extraction und Report Language

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