Paket: libgkarrays1 (2.1.0+dfsg-2)

[ Quellcode: libgkarrays  ]

library to query large collection of NGS sequences

Gk-arrays are provided as a simple-to-use C++ library dedicated to queries on large collection of sequences as produced by high-throughput sequencers (e.g. HiSeq 2000 from Illumina, 454 from Roche).

Gk-arrays index k-mers of reads and allows one to answer different queries on that read collection (e.g. how many reads share this k-mer? where does this k-mer occur in the read collection?).

Gk-arrays consist of a space-efficient alternative to hash tables while being similar in terms of query times.

Markierungen: Rolle: Laufzeit-Bibliothek

Andere Pakete mit Bezug zu libgkarrays1

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nicht armhf]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

libgkarrays1 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	53,9 kB	155,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	52,2 kB	150,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	58,0 kB	138,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	66,4 kB	190,0 kB	[Liste der Dateien]