[ Quellcode: scoary ]
Paket: scoary (1.6.16-1)
Links für scoary
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket scoary herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Afif Elghraoui (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
pangenome-wide association studies
Scoary is designed to take the gene_presence_absence.csv file from Roary as well as a traits file created by the user and calculate the associations between all genes in the accessory genome and the traits. It reports a list of genes sorted by strength of association per trait.
Andere Pakete mit Bezug zu scoary
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- dep: python
- Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python2-Version)
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- dep: python (>= 2.7)
- Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python2-Version)
- oder python-argparse
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch libpython2.7-stdlib
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- dep: python-pkg-resources
- Paketermittlung und Ressourcenzugriff mittels pkg_resources
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- dep: python-scipy
- wissenschaftliche Werkzeuge für Python
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- sug: roary
- high speed stand alone pan genome pipeline
scoary herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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| all | 228,8 kB | 2.686,0 kB | [Liste der Dateien] |