Paket: primer3 (2.4.0-2)

[ Quellcode: primer3  ]

tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification

Primer3 picks primers for Polymerase Chain Reactions (PCRs), considering as criteria oligonucleotide melting temperature, size, GC content and primer-dimer possibilities, PCR product size, positional constraints within the source sequence, and miscellaneous other constraints. All of these criteria are user-specifiable as constraints, and some are specifiable as terms in an objective function that characterizes an optimal primer pair.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: scope::utility, works-with-format::plaintext, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu primer3

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• sug: ncbi-epcr

  Tool to test a DNA sequence for the presence of sequence tagged sites

• enh: emboss

  Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
i386	178,7 kB	703,0 kB	[Liste der Dateien]