Paket: embassy-domainatrix (0.1.660-3)

[ Quellcode: embassy-domainatrix  ]

Zusätzliche EMBOSS-Kommandos zur Arbeit mit Domänen-Klassendateien

Die DOMAINATRIX-Programme wurden von Jon Ison und Kollegen am MRC HGMP für ihre Forschung im Bereich der Proteine entwickelt. Diese sind in einem Paket nammens EMBASSY enthalten, welches z.Z. in Arbeit ist.

Anwendungen der aktuellen Veröffentlichung von domainatrix sind cathparse (generiert DCF-Dateien von »raw«-CATH-Dateien), domainnr (entfernt redundante Bereiche aus einer DCF-Datei), domainreso (entfernt Bereiche niedriger Auflösung einer DCF-Datei), domainseqs (fügt Sequenzeinträge zu einer DCF-Datei hinzu), domainsse (fügt weitere Struktureinträge zu einer DCF-Datei hinzu), scopparse (generiert eine DCF-Datei aus »raw«-SCOP-Dateien) und ssematch (sucht in einer DCF-Datei nach weiteren Strukturübereinstimmungen).

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Anwendungs-Suite: suite::TODO, use::analysing, Zweck: Daten-Konvertierung, Bearbeiten, use::searching, works-with-format::TODO, Unterstützt Formate: Reiner Text, Arbeitet mit: Benötige eine zusätzliche Markierung

Andere Pakete mit Bezug zu embassy-domainatrix

• dep: emboss-lib (<< 6.6.1~)

  EMBOSS-Bibliotheken

  dep: emboss-lib (>= 6.6.0-1~)

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libx11-6

  Clientseitige X11-Bibliothek

• rec: emboss

  Europäische, quelloffene Software-Suite für Molekularbiologie

• sug: embassy

  Paket nicht verfügbar

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
i386	61,2 kB	496,0 kB	[Liste der Dateien]