Paket: daligner (1.0+git20180524.fd21879-1)

[ Quellcode: daligner  ]

local alignment discovery between long nucleotide sequencing reads

These tools permit one to find all significant local alignments between reads encoded in a Dazzler database. The assumption is that the reads are from a Pacific Biosciences RS II long read sequencer. That is, the reads are long and noisy, up to 15% on average.

Markierungen: Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, Rolle: Programm

Andere Pakete mit Bezug zu daligner

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• sug: dascrubber

  alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

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