Paket: biosquid (1.9g+cvs20050121-11)

[ Quellcode: biosquid  ]

Hilfsprogramme für die biologische Sequenzanalyse

SQUID ist eine Bibliothek von C-Code-Funktionen für die Sequenzanalyse. Sie enthält auch eine Reihe von kleinen Hilfswerkzeugen, um Sequenzdateien zu konvertieren, Statistiken anzuzeigen, diese zu manipulieren und andere Funktionen auf sie anzuwenden.

Ursprünglich war der Paketname »squid«, da jedoch bereits ein Paket namens »squid« im Archiv vorhanden war (ein Proxy-Cache), wurde es auf »biosquid« umbenannt.

Dieses Paket enthält einige Werkzeuge, welche die Möglichkeiten der Bibliothek demonstrieren.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Hilfswerkzeug, Zweck: use::comparing, use::converting, Bearbeiten, Unterstützt Formate: works-with-format::TODO, works-with::TODO

Andere Pakete mit Bezug zu biosquid

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libsquid1 (= 1.9g+cvs20050121-11)

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• rec: hmmer

  Profil-Hidden-Markov-Modelle für Protein-Sequenzanalyse

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
i386	77,1 kB	333,0 kB	[Liste der Dateien]