Paket: libhts2 (1.9-12~deb10u1)

[ Quellcode: htslib  ]

C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

HTSlib ist eine Implementierung einer vereinheitlichten C-Bibliothek für den Zugriff auf gängige Dateiformate, wie SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM und VCF (Variant Call Format), die für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten verwendet werden, und ist die von samtools und bcftools verwendete Kernbibliothek. HTSlib hängt nur von zlib ab. Es ist bekannt, dass sie mit gcc, g++ und clang kompatibel ist.

HTSlib implementiert einen verallgemeinerten BAM-Index (binary SAM) mit der Dateierweiterung »csi« (coordinate-sorted index). Der HTSlib-Dateileser sucht zuerst nach dem neuen Index und dann nach dem alten, wenn der neue Index nicht vorhanden ist.

Markierungen: Rolle: Laufzeit-Bibliothek

Andere Pakete mit Bezug zu libhts2

• dep: libbz2-1.0

  Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek

• dep: libc6 (>= 2.23)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

  Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (GnuTLS-Variante)

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  Schnelle DEFLATE-basierte Komprimierung und Dekomprimierung im gesamten Puffer

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Bibliothek für das XZ-Kompressionsformat

• dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)

  Werkzeugsatz für das Secure Socket Layer (SSL) - Laufzeitbibliotheken

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

libhts2 herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
armhf	255,0 kB	468,0 kB	[Liste der Dateien]