Paket: hmmer2-pvm (2.3.2+dfsg-6)

[ Quellcode: hmmer2  ]

HMMER mit Unterstützung für PVM (Parallel Virtual Machine)

HMMER ist eine Implementierung der Profile-Hidden-Markov-Modelle für eine sensitive Suche in biologischen Sequenzdatenbanken mit multiplen Sequenzalignments als Anfragen.

Mit einem multiplen Sequenzalignment als Eingabe baut HMMER ein statistisches Modell, genannt »Hidden-Markov-Modell«. Mit diesem kann in Sequenzdatenbanken nach homologen Sequenzen gesucht werden. Dabei können gleichzeitig, der gesuchten Proteinfamilie zugehörige, Sequenzen alignt werden.

Dieses Paket hat HMMER Programme mit einer Option kompiliert, das die Nutzung der PVM Bibliothek für verteiltes Rechnen gestattet.

Andere Pakete mit Bezug zu hmmer2-pvm

• dep: libc6 (>= 2.7)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libpvm3

  Parallel Virtual Machine - Shared Libraries

• dep: libsquid1

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• dep: pvm

  Parallel-Virtuelle Maschine - Binärprogramme

• sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-6)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
armhf	77,8 kB	340,0 kB	[Liste der Dateien]