Paket: perlprimer (1.2.4-1)

Links für perlprimer

Debian-Ressourcen:

Quellcode-Paket perlprimer herunterladen:

Betreuer:

Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
Steffen Moeller (QS-Seite)
Charles Plessy (QS-Seite)
Andreas Tille (QS-Seite)

Externe Ressourcen:

Homepage [perlprimer.sourceforge.net]

Grafischer Entwurf von Primern für PCR

PerlPrimer ist eine freie grafische Open-Source-Anwendung, geschrieben in Perl, für die Spezifikation von Primern für normale Polymerase-Kettenreaktionen (PCR), Bisulfit-PCR, Echtzeit-PCR (QPCR) und zur Sequenzierung. Sie soll den Entwurfsprozess automatisieren und vereinfachen.

Bei bestehender Internetverbindung wird die Genomdatenbank Ensembl abgefragt, um weitere Informationen über die Genstruktur zu bekommen, also die Lage von Exons und Introns für das Design der Primer zu berücksichtigen. Auch die Sequenzen selbst können abgefragt werden.

Markierungen: Biologie: Clustal/ALN, Proteine, Feld: field::biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:molecular, implemented-in::perl, Benutzer-Schnittstellen: Kommandozeile, interface::graphical, interface::x11, Vernetzung: Client, Rolle: Programm, Zweck: scope::utility, uitoolkit::tk, Zweck: Analyse, Unterstützt Formate: works-with-format::plaintext, x11::application

Andere Pakete mit Bezug zu perlprimer

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libwww-perl

Einfache und konsistente Schnittstelle zum World Wide Web
dep: perl-tk

Perl-Modul, ermöglicht Zugriff auf die Tk-Grafikbibliothek

rec: ncbi-tools-bin

NCBI libraries for biology applications (text-based utilities)

sug: perlprimer-doc

Tutorial für perlprimer

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