Paket: murasaki (1.68.6-8 und andere)

[ Quellcode: murasaki  ]

homology detection tool across multiple large genomes

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

Andere Pakete mit Bezug zu murasaki

• dep: libboost-filesystem1.67.0

  Dateisystemoperationen (portable Pfade, Iterationen über Verzeichnisse, usw.) in C++

• dep: libboost-iostreams1.67.0

  Boost.Iostreams-Bibliothek

• dep: libboost-regex1.67.0 (>= 1.67.0-10)

  C++-Bibliothek für reguläre Ausdrücke

• dep: libboost-system1.67.0

  Betriebssystemsbibliothek (etwa Unterstützung der Diagnostik)

• dep: libc6 (>= 2.17)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libcrypto++6

  Universal-Kryptografiebibliothek - Laufzeitbibliotheken

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: murasaki-common

  homology detection tool across multiple large genomes (common files)

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
arm64	1.68.6-8+b1	443,2 kB	3.063,0 kB	[Liste der Dateien]