Paket: snakemake (5.4.0-1)

[ Quellcode: snakemake  ]

pythonic workflow management system

Build systems like GNU Make are frequently used to create complicated workflows, e.g. in bioinformatics. This project aims to reduce the complexity of creating workflows by providing a clean and modern domain specific language (DSL) in Python style, together with a fast and comfortable execution environment.

Andere Pakete mit Bezug zu snakemake

• dep: ca-certificates

  Häufig genutzte Zertifizierungsstellen

• dep: libjs-d3

  JavaScript-Visualisierungsbibliothek für HTML und SVG

• dep: libjs-mathjax

  JavaScript-Engine zur Anzeige von LaTeX und MathML

• dep: libjs-sphinxdoc (>= 1.0)

  JavaScript-Unterstützung für Sphinx-Dokumentation

• dep: python3

  Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python3-Standardversion)

• dep: python3-appdirs

  determining appropriate platform-specific directories (Python 3)

• dep: python3-configargparse

  Ersatz für argparse mit Konfigurationsdateien und Umgebungsvariablen (Python 3)

• dep: python3-datrie

  Super-fast, efficiently stored Trie for Python 3

• dep: python3-docutils

  Textverarbeitungssystem für reStructuredText (Python-3-Implementierung)

• dep: python3-git

  Python library to interact with Git repositories - Python 3.x

• dep: python3-jsonschema

  Eine (andere) Implementierung von JSON Schema (Draft 3 und 4) - Python 3.x

• dep: python3-networkx

  Werkzeug zum Erstellen, Manipulieren und Studieren komplexer Netzwerke (Python 3)

• dep: python3-psutil

  Modul mit komfortablen Funktionen für die Prozessverwaltung (Python 3)

• dep: python3-pygraphviz

  Python interface to the Graphviz graph layout and visualization package (Python 3)

• dep: python3-pytools

  big bag of things supplementing Python 3 standard library

• dep: python3-ratelimiter

  simple Python library for limiting the rate of operations

• dep: python3-recommonmark

  CommonMark utility for Docutils and Sphinx projects -- Python 3

• dep: python3-requests

  Elegante und einfache Python-3-HTTP-Bibliothek, für Menschen gebaut

• dep: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

• dep: python3-setuptools

  Erweiterungen für die Python3 Distutils

• dep: python3-wrapt

  Decorators, Wrapper und »monkey patches« - Python 3.x

• dep: python3-yaml

  Python3-Parser und -Emitter für YAML

• dep: sphinx-rtd-theme-common (>= 0.4.2+dfsg)

  sphinx theme from readthedocs.org (common files)

• rec: python3-boto

  Python interface to Amazon's Web Services - Python 3.x

• rec: r-cran-rmarkdown

  Konvertierung von R-Markdown-Dokumenten in verschiedene Formate

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