Paket: arden (1.0-5)

[ Quellcode: arden  ]

Genaue Kontrolle für das Lesen von Alignierungen unter Verwendung einer künstlichen Intelligenz

ARDEN (Artificial Reference Driven Estimation of false positives in NGS data) ist für DNA-Sequenzierung der nächsten Generation ein neuartiges Bewertungsprogramm zum Abschätzen von Fehlerraten basierend auf experimentell gewonnenen DNA-Fragmenten (reads) und einem zusätzlich generierten künstlichem Genom. Es ermöglicht die Berechnung von Fehlerraten von einem spezifizierten Datensatz und die Konstruktion einer ROC-Kurve. Nebenbei kann es für die Optimierung von Parametern für read mappers, zur Auswahl von read mappers für ein spezifisches Problem oder zum Filtern von Alignierungen basierend auf Qualitätsabschätzungen genutzt werden.

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