Paket: fastqtl (2.184+dfsg-7 und andere)

[ Quellcode: fastqtl  ]

Quantitative Trait Loci (QTL) mapper in cis for molecular phenotypes

The goal of FastQTL is to identify single-nucleotide polymorphisms (SNPs) which are significantly associated with various molecular phenotypes (i.e. expression of known genes, cytosine methylation levels, etc). It performs scans for all possible phenotype-variant pairs in cis (i.e. variants located within a specific window around a phenotype). FastQTL implements a new permutation scheme (Beta approximation) to accurately and rapidly correct for multiple-testing at both the genotype and phenotype levels.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Benutzer-Schnittstellen: interface::commandline, role::program, Zweck: Analyse

Andere Pakete mit Bezug zu fastqtl

• dep: libblas3

  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

  oder libblas.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

  Boost.Iostreams-Bibliothek

• dep: libboost-program-options1.74.0 (>= 1.74.0)

  C++-Bibliothek für Programmoptionen

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libgsl25 (>= 2.6)

  GNU Scientific Library -- Bibliothekspaket

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: r-mathlib

  Eigenständige Mathematikbibliothek für GNU R

• sug: fastqtl-doc

  QTL mapper in cis for molecular phenotypes - documentation

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Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
s390x	2.184+dfsg-7+b4	166,8 kB	657,0 kB	[Liste der Dateien]